я думаю, що все ж таки проблема в драйверах на відео. перідично бувае (після встановлення чогось нового або оновлення системи), що драйвера/ікси/OpenGl/ще що небудь не правильно налаштовані. я б радив зробити так:
1) sudo nvidia-xconfig - скидае налаштування на стандартні.
2) дізнатись, яка відеокарта, знести драйвера з репозиторіїв і встановити пропріетарні (з сайта виробника)
3)заархівувати і видалити папку ~/.compiz а тоді повторити пункт 2
якщо не допоможе - пиши в приват - підключусь, подивлюся