Я тут трохи покопав і нарив, що з системних програм зависають ті, які запускаються ч-з команду gksu. Можливо проблема в якихось файлах конфігурації або з паролями.
і ще одне зауваження, вікно d4x, яке я пробував запускати від свого імені відрізняється від вікна, що запускалось від імені рута. Тупо кажучи оформлення інше, і в моєму вікні в списку стоять три завантаження, а в рута вікно порожнє. Хоча можливо так і повинно було бути, цеж не вінда. і ще одне я не міг знайти файл конфігурації цього d4x. Коли видаляв, ставив "повне видалення" з файлами крнфігупації, а після перевстановлення все повторювалось.